Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms