Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms