Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms