Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms