Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pard6bQ9JK83 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms