Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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