Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms