Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tssc4Q9JHE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms