Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln2Q9ESM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms