Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms