Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx12Q9ER00 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms