Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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