Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm9sf1Q9DBU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms