Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms