Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift46Q9DB07 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms