Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms