Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms