Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrps9Q9D7N3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms