Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc94Q9D6J3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms