Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11fip1Q9D620 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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