Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms