Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms