Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms