Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms