Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms