Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmed11Q9D2R4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed11Q9D2R4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmed11Q9D2R4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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