Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chordc1Q9D1P4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms