Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube2cQ9D1C1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms