Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms