Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Srfbp1Q9CZ91 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms