Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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