Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Sgo1Q9CXH7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Sgo1Q9CXH7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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