Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms