Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms