Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms