Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rprd1bQ9CSU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rprd1bQ9CSU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rprd1bQ9CSU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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