Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gdpd1Q9CRY7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd1Q9CRY7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gdpd1Q9CRY7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd1Q9CRY7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms