Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms