Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PompQ9CQT5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms