Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DenrQ9CQJ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DenrQ9CQJ6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms