Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms