Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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