Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrbp1Q99PL5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms