Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cep41Q99NF3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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