Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms