Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mrps18aQ99N85 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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