Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrtQ99MR6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms