Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms