Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhddsQ99KU1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms