Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms